两部曼荼羅，又称两界曼荼罗，包括金剛界曼荼羅和胎藏界曼荼羅，代表唐密和東密的兩大根本教法。
金刚界代表佛的不可转变宇宙原则，胎藏界示范了佛在世界的活动。曼荼罗因此表达了大乘佛教的法与金刚乘的教导，在日本真言宗寺院经常有两部曼荼罗出现。两部在印度是分开发展，最早可能是惠果时代出现在中国。
