酶学委员会编号
提示：此条目的主题不是欧盟委员会编号。
关于EC编号的其它用法，请见「EC编号」。酶学委员会编号或酶编号（英語：Enzyme Commission number），简称EC编号或EC号（EC number），是一种基于酶催化化学反应而制定数字分类方案。[1]作为酶命名法 / 酶学委员会命名法（enzyme nomenclature）系统，[2]同時會為各種酶給予一個建議的名稱，且每个EC编号都与相应酶催化反应的推荐名称相关联。
EC编号并非针对不同种类的酶，而是针对酶催化的反应。如果不同的酶（例如来自不同生物体的酶）催化相同的反应，则它们会获得相同的EC编号。[3]此外，通过趋同进化，完全不同的蛋白质折叠可以催化相同的反应（这些有时被称为非同源同功能酶）[4]因此会被分配相同的EC编号。相比之下，联合蛋白数据库标识符通过氨基酸序列唯一地指定蛋白质。[5]
编号数字格式
[编辑]每个酶代码均由字母“EC”和四个以句点分隔的数字组成（例如EC X.X.X.X）。这些数字代表酶的逐级精细分类。目前存在一些初步认定的EC编号，其第四位（序列号）数字包含“n”（例如 EC 3.5.1.n3）。[3]
例如，三肽氨基肽酶的编号为“EC 3.4.11.4”，其组成部分表示以下酶组：
- EC 3代指水解酶（利用水分解其他分子的酶）
- EC 3.4代指是作用于肽键的水解酶
- EC 3.4.11.4指从三肽氨基末端裂解的酶
顶层编号
[编辑]注意：酶分类编号与“格式编号”不同
| 组别 | 被催化的化学反应 | 典型反应 | 酶的例子（俗名） |
|---|---|---|---|
| EC 1 氧化还原酶 |
AH + B → A + BH (还原) A + O → AO (氧化) |
脱氢酶、氧化酶 | |
| EC 2 转移酶 |
将官能团从一种物质转移到另一种物质。该基团可以是甲基、酰基、氨基或磷酸基 | AB + C → A + BC | 转氨酶、激酶 |
| EC 3 水解酶 |
通过水解底物并形成两种产物 | AB + H2O（水分子） → AOH + BH | 脂肪酶、蛋白酶 / 肽酶、淀粉酶、磷酸酶 |
| EC 4 裂合酶 |
非水解性地从底物增加或去除某些基团。碳-碳键（C-C）、碳-氮键（C-N）、碳-氧键（C-O） 或碳-硫键（C-S）等共價鍵可能会断裂 | RCOCOOH（羧基） → RCOH（醛基） + CO2（二氧化碳）或[X-A+B-Y] → [A=B + X-Y] | 羧基裂合酶 / 脱羧酶 |
| EC 5 异构酶 |
对分子内进行重新排列，即单个分子内的同分异构化 | ABC → BCA | 异构酶、变位酶 |
| EC 6 连接酶 |
通过合成新的碳-氧、碳-硫、碳-氮或碳-碳键并同时分解三磷酸腺苷，将两个分子连接在一起 | X + Y + ATP（三磷酸腺苷） → XY + ADP（二磷酸腺苷） + Pi（磷酸） | 合成酶 |
| EC 7 易位酶 |
催化离子或分子跨膜运动或膜内分离 | 膜转运蛋白 |
反应相似性
[编辑]可以通过使用化学键变化、反应中心或亚结构指标（以前称为 EC-BLAST，现为EMBL-EBI酶门户）来计算酶促反应之间的相似性。[7]
历史
[编辑]在EC编号系统发展之前，酶的命名是任意的，通常使用诸如老黄酶（old yellow enzyme）和苹果酸酶之类的名称，这些名称很少或根本没有提供任何有关所催化反应的线索。大多数这些名称已不再使用，但仍有少数名称在使用，尤其是特异性很低的蛋白水解酶，例如胃蛋白酶和木瓜蛋白酶，因为根据特异性进行合理分类非常困难。
到了20世纪50年代，混乱已经让人无法忍受，在霍夫曼-奥斯滕霍夫（Hoffman-Ostenhof）[8]、迪克森（Dixon）和韦伯（Webb）[9]提出了类似的酶催化反应分类方案，1955年在布鲁塞尔举行的国际生物化学大会成立了酶委员会，由马尔科姆·迪克森担任主席。第一版命名书籍发布于1961年，酶委员会随即解散，但其名称以EC编号这一术语保留了下来。目前的第六版由国际生物化学和分子生物学联合会于 1992年出版，是最后一个以印刷书籍形式出版的版本，包含3196种不同的酶。补编1—4出版于1993年至1999年。后续补编已以电子版形式发布在国际生物化学与分子生物学联盟（IUBMB）命名委员会的网站上。[6]2018年8月，IUBMB修改了该系统，添加了顶级EC 7（第七类）酶类别，即易位酶。[10][11]
参见
[编辑]参考文献
[编辑]- ^ Webb, E. C. Enzyme nomenclature 1992: recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the nomenclature and classification of enzymes
. Academic Press. 1992. ISBN 978-0-12-227164-9.
- ^ 术语在线. [2025-07-16].
- ^ 3.0 3.1 ENZYME (Enzyme nomenclature database). ExPASy. [24 April 2019]. （原始内容存档于21 March 2019）.
- ^ Omelchenko MV, Galperin MY, Wolf YI, Koonin EV. Non-homologous isofunctional enzymes: a systematic analysis of alternative solutions in enzyme evolution. Biology Direct. 2010, 5 (1): 第31页. PMC 2876114
. PMID 20433725. doi:10.1186/1745-6150-5-31 .
- ^ Apweiler R, Bairoch A, Wu CH, Barker WC, Boeckmann B, Ferro S, Gasteiger E, Huang H, Lopez R, Magrane M, Martin MJ, Natale DA, O'Donovan C, Redaschi N, Yeh LS. UniProt: the Universal Protein knowledgebase. Nucleic Acids Research. Jan 2004, 32 (Database issue): D115–9. PMC 308865 . PMID 14681372. doi:10.1093/nar/gkh131.
- ^ 6.0 6.1 Moss GP. Recommendations of the Nomenclature Committee. International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the Nomenclature and Classification of Enzymes by the Reactions they Catalyse. [2006-03-14]. （原始内容存档于2018-09-10）.
- ^ Rahman SA, Cuesta SM, Furnham N, Holliday GL, Thornton JM. EC-BLAST: a tool to automatically search and compare enzyme reactions. Nature Methods. Feb 2014, 11 (2): 171–174. PMC 4122987 . PMID 24412978. doi:10.1038/nmeth.2803.
- ^ Hoffman-Ostenhof, O. Suggestions for a more rational classification and nomenclature of enzymes. Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology 14. 1953: 219–260. ISBN 9780470122594. PMID 13057718. doi:10.1002/9780470122594.ch7.
- ^ Dixon, M; Webb, E.C. Enzymes. London: Longmans Green. 1958: 183–227.
- ^ Tipton, Keith. Enzyme Nomenclature News: Translocases (EC 7): A new EC Class. ExplorEnz: the primary source of the IUBMB enzyme list. August 2018 [3 November 2018]. （原始内容存档于10 September 2018）.
- ^ 术语在线. [2025-07-16].
外部链接
[编辑]
- 酶命名法，国际生物化学和分子生物学联合会命名委员会的权威网站，由G.P.莫西（G.P.Moss）维护
- 酶命名数据库—专家蛋白质分析系统（ExPASy）
- 所有EC编号列表—不伦瑞克酶学数据库（BRENDA）
- 按EC编号浏览蛋白质数据库（PDB）结构
- 按EC编号浏览SCOP域名—结构域中心基因本体数据库（dcGO）
- 使用EC-Blast比较EC编号 互联网档案馆的存檔，存档日期2019-05-30.
