G蛋白偶联受体数据库
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| 内容 | |
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| 说明（描述） | G蛋白偶联受体 数据、网络工具和图表 |
| 获取的数据类型 | 结构、突变体、序列 |
| 相关信息 | |
| 研究中心 | 哥本哈根大学 |
| 作者（创始人） | Vignir Isberg, Bas Vrolin, Gert Vriend, David Gloriam and others. |
| 主要参考文献（引用） | Pandy-Szekeres G, Munk C, Tsonkov TM, Mordalski S, Harpsoe K, Hauser AS, Bojarski AJ, Gloriam DE. [1] |
| 发布日期 | 1993 |
| 访问 | |
| 网站 | https://www.gpcrdb.org |
| 网络服务网址 | https://gpcrdb.org/services/ |
| 其它信息 | |
| 管理政策 | 基于人工的实验数据 |
GPCRdb数据库是G蛋白偶联受体（GPCR）的主要数据存储库。它整合了各种用于GPCR分析的网页工具和图表，并存储了通过PDB（蛋白質資料庫）发布的所有GPCR晶体结构的注释信息，拥有最大的受体突变体和参考序列比对集合。用户可在GPCRdb主页上使用一系列工具，通过网页浏览器分析结构、序列相似性、受体关系、同源模型、药物趋势、遗传变异和配體靶点谱。图表则以蛇形图和螺旋盒图的形式展示受体序列及其关系（系统发育树）。[2]
参见
[编辑]参考文献
[编辑]- ^ Pandy-Szekeres, Gaspar; Munk, Christian; Tsonkov, Tsonko; Mordalski, Stefan; Harpsoe, Kasper; Hauser, Alexander; Bojarski, Andrzej; Gloriam, David. GPCRdb in 2018: adding GPCR structure models and ligands. Nucleic Acids Research. 2017-11-16, 46 (D1): D440–D446. PMC 5753179
. PMID 29155946. doi:10.1093/nar/gkx1109 .
- ^ Isberg, Vignir; Graaf, Chris de; Bortolato, Andrea; Cherezov, Vadim; Katritch, Vsevolod; Marshall, Fiona H.; Mordalski, Stefan; Pin, Jean-Philippe; Stevens, Raymond C. Generic GPCR residue numbers – aligning topology maps while minding the gaps. Trends in Pharmacological Sciences. 2015-01-01, 36 (1): 22–31. PMC 4408928 . PMID 25541108. doi:10.1016/j.tips.2014.11.001.
外部链接
[编辑]- GPCRdb GPCR数据库
- GLISTEN EU COST 针对 GPCR 的行动
- GPCR-HGmod预测人类基因组中所有 GPCR 的结构模型
- GPCR-EXP数据库收录了所有实验解析的GPCR结构。