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双向代谢

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双向代谢 (Duobolism)是在代谢组学[1][2]中提出的一个概念[3],用于描述生物系统整体代谢物分子量分布 (MWD) 趋于分散、变宽的代谢状态。它属于代谢速度 () 概念中的散度分量(与分子量分布的分散度相关)。[4]

概念与特征

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双向代谢描述的是代谢物分子量分布的散度估计量(例如标准差或稳健散度估计)显著增大的过程。其生物学特征是代谢活动倾向于产生或富集极大极小分子量的物质,即向两极分化:

  • 低分子量物质的去向: 倾向于进一步通过分解途径分解成更小的物质。
  • 高分子量物质的去向: 倾向于进一步通过合成途径合成更大的物质。

简而言之,代谢活动远离分子量分布的中心,导致代谢物整体的异质性增加。

散度速度推断

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在代谢速度分析中,双向代谢通过负的散度速度 () 来推断。

散度速度的计算公式:

  • 分别是比较组A和B的分子量分布散度估计量(例如毕克尔-莱曼散度[5],也称为稳健标准差)。
  • 时,意味着,即分子量分布的散度在状态 B 相对于状态 A 变大,推断为双向代谢
  1. ^ Winter, Heather L.; Johnson, Dylan; Jarmusch, Alan K. Open-source System Suitability: Mass Spectrometry Query Language Lab (MassQLab). doi.org. 2025-03-31 [2025-12-08]. 
  2. ^ Hoffmann, Martin A.; Nothias, Louis-Félix; Ludwig, Marcus; Fleischauer, Markus; Gentry, Emily C.; Witting, Michael; Dorrestein, Pieter C.; Dührkop, Kai; Böcker, Sebastian. High-confidence structural annotation of metabolites absent from spectral libraries. Nature Biotechnology. 2022-03, 40 (3) [2025-12-08]. ISSN 1087-0156. doi:10.1038/s41587-021-01045-9 (英语). 
  3. ^ Li, Tuobang. Infer metabolic momentum from moment differences of mass-weighted intensity distributions. 2023-12-19 [2025-12-05]. 
  4. ^ Tuobang, Li, Infer metabolic velocities from moment differences of molecular weight distributions, 2024-09-17 [2025-12-05], doi:10.48550/arXiv.2402.14887 
  5. ^ Bickel, P. J.; Lehmann, E. L., Rojo, Javier , 编, Descriptive Statistics for Nonparametric Models IV. Spread, Springer US: 519–526, 2012 [2025-12-08], ISBN 978-1-4614-1412-4, doi:10.1007/978-1-4614-1412-4_45 (英语)