模板:Infobox protein family/sandbox
外观
| Infobox protein family/sandbox | |
|---|---|
| 鉴定 | |
| 标志 | ? |
| 这是Template:Infobox protein family(差异)的沙盒。 参见本模板的测试样例。 |
| 此模板沙盒被引用于许多页面。 为了避免造成大规模的影响,所有对此模板沙盒的编辑应先于沙盒、测试样例或您的沙盒上测试。 测试后无误的版本可以一次性地加入此模板沙盒中,但是修改前请务必于讨论页发起讨论。 模板引用数量会自动更新。 |
| 此模板使用Lua语言: |
该模板为蛋白质家族信息框(Infobox protein family),是利用生物数据库(例如如Pfam)中定义的蛋白质家族/域的模板。
用法
[编辑]要使用此模板,请复制以下文本并将其粘贴到文章顶部。请尽可能填写所有字段,即使缺少某些信息也无需担心。
{{Infobox protein family
| class = <!-- 为了节省空间:mw-collapsible mw-collapsed -->
| Symbol =
| Name =
| image =
| caption =
| Pfam =
| Pfam_clan =
| ECOD =
| InterPro =
| SMART =
| PROSITE =
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP =
| TCDB =
| OPM family = <!-- 实际上是OPM超家族。仅当蛋白质家族与“超家族”完全匹配时才写入! -->
| OPM protein =
| CAZy =
| CDD =
| Membranome superfamily = <!-- 与上述相同:仅当完全匹配时。 -->
| Membranome family =
}}
例子
[编辑]以下填写的Pfam信息框模板会生成右侧的信息框。
| 配体结合域 (Ligand-binding domain,LBD) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 标识符 | |||||||||
| 符号 | Hormone_recep | ||||||||
| 蛋白质家族数据库(Pfam) | PF00104 | ||||||||
| 蛋白质结构域进化分类(ECOD) | 188.1.1.1 | ||||||||
| 蛋白质互联数据库(InterPro) | IPR000536 | ||||||||
| 简单模块化结构研究工具(SMART) | SM00430 | ||||||||
| 分类-结构-拓扑折叠-同源超家族蛋白质数据库(CATH) | 1lbd | ||||||||
| 蛋白质结构分类数据库2(SCOP2) | 1lbd / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| 保守域数据库(CDD) | cd06157 | ||||||||
| |||||||||
{{Infobox protein family
| Symbol = Hormone_recep
| class = collapsible
| Name = 配体结合域 (Ligand-binding domain,LBD)
| image = RORC_3L0L.png
| caption = {{le|视黄酸受体相关孤儿受体γ|RAR-related orphan receptor gamma|RORγ}} ({{PDB|3L0L}})
| Pfam = PF00104
| ECOD = 188.1.1.1
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE =
| SCOP = 1lbd
| CATH = 1lbd
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd06157
}}
分类
[编辑]模板数据
[编辑]这是生物数据库(如Pfam)中定义的蛋白质家族/域的模板。
| 参数 | 描述 | 类型 | 状态 | |
|---|---|---|---|---|
| 符号 | Symbol | 无描述 | 单行文本 | 可选 |
| 名称 | Name | 无描述 | 单行文本 | 可选 |
| 图像 | image | 如果不需要隐藏跟踪类别,请填写"NONE" | 文件 | 可选 |
| 宽度 | width | 图像宽度 | 字符串 | 可选 |
| 标题 | caption | 图片标题 | 字符串 | 可选 |
| InterPro家族标识符 | InterPro | 无描述 | 未知 | 可选 |
| Pfam家族标识符 | Pfam | 自动链接到Pfam家族记录 | 单行文本 | 可选 |
| Pfam氏族标识符 | Pfam_clan | 自动链接到Pfam氏族记录;氏族是一组相关家族(~超家族)。 | 单行文本 | 可选 |
| ECOD标识符 | ECOD | 自动链接到ECOD数据库 | 单行文本 | 可选 |
| Interpro标识符 | Interpro | 自动链接到Interpro条目 | 单行文本 | 可选 |
| SMART登录号 | SMART | 自动链接到简单模块化架构研究工具中的域条目 | 单行文本 | 可选 |
| PROSITE记录标识符 | PROSITE | 自动链接到PROSITE记录搜索 | 单行文本 | 可选 |
| MEROPS记录标识符 | MEROPS | 自动链接到MEROPS记录(MEROPS的范围是肽酶及其抑制剂) | 单行文本 | 可选 |
| SCOP(域/PDB登录号) | SCOP | 给定PDB登录号或SCOP域名,自动链接到SCOP和SUPFAMpage。 | 单行文本 | 可选 |
| SCOP2覆盖 | SCOP2 | SCOP和SCOP2使用不同的域命名法。如果为SCOP指定了域,请使用此值。
| 未知 | 可选 |
| CATH(域/PDB登录号) | CATH | 给定CATH域ID或PDB登录号,自动链接到CATH(蛋白质结构域分类)。 | 单行文本 | 可选 |
| TCDB标识符 | TCDB | 自动链接到转运蛋白分类数据库中的标识符搜索 | 单行文本 | 可选 |
| OPM超家族标识符 | OPM family | 自动链接到膜蛋白质方向数据库中的超家族记录。 | 单行文本 | 可选 |
| OPM蛋白质标识符 | OPM protein | 值通常是PDB标识符;自动链接到膜中蛋白质方向数据库中的蛋白质记录 | 单行文本 | 可选 |
| CAZy家族标识符 | CAZy | 自动链接到碳水化合物活性酶数据库中的家族描述页面。 | 单行文本 | 可选 |
| CDD uid | CDD | 自动链接到保守域数据库中的记录 | 单行文本 | 可选 |
| align | align | 无描述 | 未知 | 可选 |
| image_size | image_size | 无描述 | 未知 | 可选 |
| alt | alt | 无描述 | 未知 | 可选 |
| Membranome superfamily | Membranome superfamily | 无描述 | 未知 | 可选 |
| Membranome family | Membranome family | 无描述 | 未知 | 可选 |
| class | class | 信息框级别
| 未知 | 可选 |
| below | below | 脚注 | 未知 | 可选 |
| PDB | PDB | PDB示例。仅在以下情况使用:无可用图像、无CATH/SCOP示例、InterPro或PDB搜索失败。 | 内容 | 弃用 |