模板:Infobox protein family/sandbox
外觀
| Infobox protein family/sandbox | |
|---|---|
| 鑑定 | |
| 標誌 | ? |
| 這是Template:Infobox protein family(差異)的沙盒。 參見本模板的測試樣例。 |
| 此模板沙盒被引用於許多頁面。 為了避免造成大規模的影響,所有對此模板沙盒的編輯應先於沙盒、測試樣例或您的沙盒上測試。 測試後無誤的版本可以一次性地加入此模板沙盒中,但是修改前請務必於討論頁發起討論。 模板引用數量會自動更新。 |
| 此模板使用Lua語言: |
該模板為蛋白質家族資訊框(Infobox protein family),是利用生物資料庫(例如如Pfam)中定義的蛋白質家族/域的模板。
用法
[編輯]要使用此模板,請複製以下文本並將其粘貼到文章頂部。請儘可能填寫所有欄位,即使缺少某些資訊也無需擔心。
{{Infobox protein family
| class = <!-- 为了节省空间:mw-collapsible mw-collapsed -->
| Symbol =
| Name =
| image =
| caption =
| Pfam =
| Pfam_clan =
| ECOD =
| InterPro =
| SMART =
| PROSITE =
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP =
| TCDB =
| OPM family = <!-- 实际上是OPM超家族。仅当蛋白质家族与“超家族”完全匹配时才写入! -->
| OPM protein =
| CAZy =
| CDD =
| Membranome superfamily = <!-- 与上述相同:仅当完全匹配时。 -->
| Membranome family =
}}
例子
[編輯]以下填寫的Pfam資訊框模板會生成右側的資訊框。
| 配體結合域 (Ligand-binding domain,LBD) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 標識符 | |||||||||
| 符號 | Hormone_recep | ||||||||
| 蛋白質家族資料庫(Pfam) | PF00104 | ||||||||
| 蛋白質結構域進化分類(ECOD) | 188.1.1.1 | ||||||||
| 蛋白質互聯資料庫(InterPro) | IPR000536 | ||||||||
| 簡單模組化結構研究工具(SMART) | SM00430 | ||||||||
| 分類-結構-拓撲摺疊-同源超家族蛋白質資料庫(CATH) | 1lbd | ||||||||
| 蛋白質結構分類資料庫2(SCOP2) | 1lbd / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| 保守域資料庫(CDD) | cd06157 | ||||||||
| |||||||||
{{Infobox protein family
| Symbol = Hormone_recep
| class = collapsible
| Name = 配体结合域 (Ligand-binding domain,LBD)
| image = RORC_3L0L.png
| caption = {{le|视黄酸受体相关孤儿受体γ|RAR-related orphan receptor gamma|RORγ}} ({{PDB|3L0L}})
| Pfam = PF00104
| ECOD = 188.1.1.1
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE =
| SCOP = 1lbd
| CATH = 1lbd
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd06157
}}
分類
[編輯]模板資料
[編輯]這是生物資料庫(如Pfam)中定義的蛋白質家族/域的模板。
| 參數 | 描述 | 類型 | 狀態 | |
|---|---|---|---|---|
| 符號 | Symbol | 沒有描述 | 行 | 非必填 |
| 名稱 | Name | 沒有描述 | 行 | 非必填 |
| 圖像 | image | 如果不需要隱藏跟蹤類別,請填寫"NONE" | 檔案 | 非必填 |
| 寬度 | width | 圖像寬度 | 字串 | 非必填 |
| 標題 | caption | 圖片標題 | 字串 | 非必填 |
| InterPro家族標識符 | InterPro | 沒有描述 | 不明 | 非必填 |
| Pfam家族標識符 | Pfam | 自動連結到Pfam家族記錄 | 行 | 非必填 |
| Pfam氏族標識符 | Pfam_clan | 自動連結到Pfam氏族記錄;氏族是一組相關家族(~超家族)。 | 行 | 非必填 |
| ECOD標識符 | ECOD | 自動連結到ECOD資料庫 | 行 | 非必填 |
| Interpro標識符 | Interpro | 自動連結到Interpro條目 | 行 | 非必填 |
| SMART登入號 | SMART | 自動連結到簡單模組化架構研究工具中的域條目 | 行 | 非必填 |
| PROSITE記錄標識符 | PROSITE | 自動連結到PROSITE記錄搜索 | 行 | 非必填 |
| MEROPS記錄標識符 | MEROPS | 自動連結到MEROPS記錄(MEROPS的範圍是肽酶及其抑制劑) | 行 | 非必填 |
| SCOP(域/PDB登入號) | SCOP | 給定PDB登入號或SCOP域名,自動連結到SCOP和SUPFAMpage。 | 行 | 非必填 |
| SCOP2覆蓋 | SCOP2 | SCOP和SCOP2使用不同的域命名法。如果為SCOP指定了域,請使用此值。
| 不明 | 非必填 |
| CATH(域/PDB登入號) | CATH | 給定CATH域ID或PDB登入號,自動連結到CATH(蛋白質結構域分類)。 | 行 | 非必填 |
| TCDB標識符 | TCDB | 自動連結到轉運蛋白分類資料庫中的標識符搜索 | 行 | 非必填 |
| OPM超家族標識符 | OPM family | 自動連結到膜蛋白質方向資料庫中的超家族記錄。 | 行 | 非必填 |
| OPM蛋白質標識符 | OPM protein | 值通常是PDB標識符;自動連結到膜中蛋白質方向資料庫中的蛋白質記錄 | 行 | 非必填 |
| CAZy家族標識符 | CAZy | 自動連結到碳水化合物活性酶資料庫中的家族描述頁面。 | 行 | 非必填 |
| CDD uid | CDD | 自動連結到保守域資料庫中的記錄 | 行 | 非必填 |
| align | align | 沒有描述 | 不明 | 非必填 |
| image_size | image_size | 沒有描述 | 不明 | 非必填 |
| alt | alt | 沒有描述 | 不明 | 非必填 |
| Membranome superfamily | Membranome superfamily | 沒有描述 | 不明 | 非必填 |
| Membranome family | Membranome family | 沒有描述 | 不明 | 非必填 |
| class | class | 資訊框級別
| 不明 | 非必填 |
| below | below | 註腳 | 不明 | 非必填 |
| PDB | PDB | PDB範例。僅在以下情況使用:無可用圖像、無CATH/SCOP範例、InterPro或PDB搜索失敗。 | 內容 | 不建議使用 |